MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 240233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017803	CG	3	6	31	36	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
2	NC_017803	CG	3	6	47	52	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
3	NC_017803	CGG	2	6	75	80	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845070
4	NC_017803	GTCG	2	8	162	169	0 %	25 %	50 %	25 %	386845070
5	NC_017803	CGCC	2	8	182	189	0 %	0 %	25 %	75 %	386845070
6	NC_017803	CTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
7	NC_017803	CCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845070
8	NC_017803	CG	3	6	285	290	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
9	NC_017803	GAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
10	NC_017803	TCA	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845070
11	NC_017803	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
12	NC_017803	CTG	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
13	NC_017803	CGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
14	NC_017803	AGG	2	6	443	448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
15	NC_017803	TTC	2	6	451	456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845070
16	NC_017803	CGC	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
17	NC_017803	GCC	2	6	588	593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
18	NC_017803	AGA	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845070
19	NC_017803	GCC	2	6	631	636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
20	NC_017803	CGA	2	6	657	662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845070
21	NC_017803	GC	3	6	716	721	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
22	NC_017803	GAG	2	6	781	786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
23	NC_017803	TGC	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845070
24	NC_017803	GCCGG	2	10	814	823	0 %	0 %	60 %	40 %	386845070
25	NC_017803	CCG	2	6	830	835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845070
26	NC_017803	ACT	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845070
27	NC_017803	GGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845070
28	NC_017803	CG	3	6	921	926	0 %	0 %	50 %	50 %	386845070
29	NC_017803	GACC	2	8	957	964	25 %	0 %	25 %	50 %	386845070
30	NC_017803	CGG	2	6	993	998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845070
31	NC_017803	ACCAC	2	10	1004	1013	40 %	0 %	0 %	60 %	386845070
32	NC_017803	CGCT	2	8	1060	1067	0 %	25 %	25 %	50 %	386845070
33	NC_017803	CTCG	2	8	2478	2485	0 %	25 %	25 %	50 %	386845071
34	NC_017803	GCCG	2	8	2522	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
35	NC_017803	CTG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
36	NC_017803	CGGC	2	8	2571	2578	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
37	NC_017803	CCAG	2	8	2609	2616	25 %	0 %	25 %	50 %	386845071
38	NC_017803	TCGG	2	8	2722	2729	0 %	25 %	50 %	25 %	386845071
39	NC_017803	GGA	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845071
40	NC_017803	CGC	2	6	2838	2843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
41	NC_017803	CGC	2	6	2877	2882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
42	NC_017803	GAT	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845071
43	NC_017803	CCA	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
44	NC_017803	ACCG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	386845071
45	NC_017803	GAC	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845071
46	NC_017803	GCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845071
47	NC_017803	CCCTGG	2	12	3095	3106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386845071
48	NC_017803	CGC	2	6	3154	3159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
49	NC_017803	ACC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
50	NC_017803	GCC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
51	NC_017803	CCG	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
52	NC_017803	CGCT	2	8	3202	3209	0 %	25 %	25 %	50 %	386845071
53	NC_017803	CGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845071
54	NC_017803	GTC	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
55	NC_017803	CAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
56	NC_017803	TGC	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
57	NC_017803	GTC	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845071
58	NC_017803	CAC	2	6	3351	3356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845071
59	NC_017803	GAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845071
60	NC_017803	GC	3	6	3461	3466	0 %	0 %	50 %	50 %	386845071
61	NC_017803	TCGT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	386845071
62	NC_017803	ATC	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845071
63	NC_017803	TGC	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
64	NC_017803	GTC	2	6	3703	3708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
65	NC_017803	CCA	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845072
66	NC_017803	CGC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845072
67	NC_017803	GTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845072
68	NC_017803	TCA	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845072
69	NC_017803	CGG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
70	NC_017803	CGA	2	6	3897	3902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
71	NC_017803	CGG	2	6	3963	3968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
72	NC_017803	CGG	2	6	4005	4010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
73	NC_017803	GCCG	2	8	4059	4066	0 %	0 %	50 %	50 %	386845072
74	NC_017803	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
75	NC_017803	ATC	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845072
76	NC_017803	CGT	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
77	NC_017803	GCT	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
78	NC_017803	CTG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845072
79	NC_017803	CGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
80	NC_017803	GAC	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
81	NC_017803	CGA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
82	NC_017803	GAC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845072
83	NC_017803	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
84	NC_017803	CGG	2	6	4476	4481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845072
85	NC_017803	TCG	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
86	NC_017803	GGT	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845073
87	NC_017803	GCT	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
88	NC_017803	GGGC	2	8	4771	4778	0 %	0 %	75 %	25 %	386845073
89	NC_017803	GGA	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845073
90	NC_017803	GAC	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
91	NC_017803	CTG	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
92	NC_017803	CGCC	2	8	4926	4933	0 %	0 %	25 %	75 %	386845073
93	NC_017803	GC	3	6	4953	4958	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
94	NC_017803	AGC	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
95	NC_017803	CTG	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
96	NC_017803	CGG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
97	NC_017803	GCT	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
98	NC_017803	GGC	2	6	5121	5126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
99	NC_017803	ACG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
100	NC_017803	CGGC	2	8	5168	5175	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
101	NC_017803	CGG	2	6	5180	5185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
102	NC_017803	GCTGC	2	10	5248	5257	0 %	20 %	40 %	40 %	386845073
103	NC_017803	GCCG	3	12	5276	5287	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
104	NC_017803	CAC	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845073
105	NC_017803	CGA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
106	NC_017803	GGC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845073
107	NC_017803	CTG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
108	NC_017803	CGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845073
109	NC_017803	GCCG	2	8	5491	5498	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
110	NC_017803	GCT	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845073
111	NC_017803	GCCG	2	8	5571	5578	0 %	0 %	50 %	50 %	386845073
112	NC_017803	CTCGG	2	10	5608	5617	0 %	20 %	40 %	40 %	386845073
113	NC_017803	CTG	3	9	5797	5805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845074
114	NC_017803	GCC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845074
115	NC_017803	CGTGC	2	10	5835	5844	0 %	20 %	40 %	40 %	386845074
116	NC_017803	CGG	2	6	5865	5870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
117	NC_017803	CGG	3	9	5900	5908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
118	NC_017803	CG	3	6	5953	5958	0 %	0 %	50 %	50 %	386845074
119	NC_017803	TGC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845074
120	NC_017803	TGA	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845074
121	NC_017803	CG	3	6	6001	6006	0 %	0 %	50 %	50 %	386845074
122	NC_017803	CCG	2	6	6022	6027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845074
123	NC_017803	GGT	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845074
124	NC_017803	CGC	2	6	6074	6079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845074
125	NC_017803	GCC	2	6	6085	6090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845074
126	NC_017803	CGG	2	6	6104	6109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
127	NC_017803	CCGG	2	8	6166	6173	0 %	0 %	50 %	50 %	386845074
128	NC_017803	CTG	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845074
129	NC_017803	GTG	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845074
130	NC_017803	CGG	2	6	6238	6243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845074
131	NC_017803	CCT	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845074
132	NC_017803	CGGT	2	8	6501	6508	0 %	25 %	50 %	25 %	386845075
133	NC_017803	CGG	2	6	6523	6528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845075
134	NC_017803	GGGCGC	2	12	6599	6610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845075
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139	NC_017803	CGG	2	6	6685	6690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845075
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261	NC_017803	GGA	2	6	12010	12015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845078
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374	NC_017803	GCGG	2	8	16530	16537	0 %	0 %	75 %	25 %	386845084
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382	NC_017803	CGG	3	9	16682	16690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845084
383	NC_017803	CGA	2	6	16720	16725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845084
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499	NC_017803	GGC	2	6	21464	21469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845092
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